Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C10orf53Q8N6V4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C10orf53Q8N6V4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C10orf53Q8N6V4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C10orf53Q8N6V4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C10orf53Q8N6V4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C10orf53Q8N6V4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C10orf53Q8N6V4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C10orf53Q8N6V4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C10orf53Q8N6V4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C10orf53Q8N6V4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C10orf53Q8N6V4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf53Q8N6V4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C10orf53Q8N6V4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C10orf53Q8N6V4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C10orf53Q8N6V4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C10orf53Q8N6V4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C10orf53Q8N6V4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C10orf53Q8N6V4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C10orf53Q8N6V4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms