Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC83Q8IWF9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC83Q8IWF9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC83Q8IWF9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC83Q8IWF9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC83Q8IWF9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC83Q8IWF9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC83Q8IWF9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC83Q8IWF9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC83Q8IWF9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC83Q8IWF9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC83Q8IWF9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC83Q8IWF9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC83Q8IWF9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC83Q8IWF9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC83Q8IWF9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC83Q8IWF9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC83Q8IWF9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC83Q8IWF9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC83Q8IWF9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC83Q8IWF9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC83Q8IWF9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC83Q8IWF9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC83Q8IWF9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC83Q8IWF9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC83Q8IWF9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC83Q8IWF9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC83Q8IWF9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC83Q8IWF9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC83Q8IWF9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC83Q8IWF9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC83Q8IWF9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC83Q8IWF9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC83Q8IWF9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC83Q8IWF9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC83Q8IWF9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC83Q8IWF9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC83Q8IWF9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC83Q8IWF9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC83Q8IWF9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC83Q8IWF9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC83Q8IWF9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC83Q8IWF9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC83Q8IWF9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC83Q8IWF9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC83Q8IWF9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC83Q8IWF9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC83Q8IWF9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC83Q8IWF9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC83Q8IWF9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CCDC83Q8IWF9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC83Q8IWF9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC83Q8IWF9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC83Q8IWF9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC83Q8IWF9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC83Q8IWF9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC83Q8IWF9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC83Q8IWF9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC83Q8IWF9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC83Q8IWF9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC83Q8IWF9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC83Q8IWF9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC83Q8IWF9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC83Q8IWF9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC83Q8IWF9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC83Q8IWF9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC83Q8IWF9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC83Q8IWF9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC83Q8IWF9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC83Q8IWF9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC83Q8IWF9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC83Q8IWF9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC83Q8IWF9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC83Q8IWF9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC83Q8IWF9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC83Q8IWF9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC83Q8IWF9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC83Q8IWF9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC83Q8IWF9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC83Q8IWF9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC83Q8IWF9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC83Q8IWF9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC83Q8IWF9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC83Q8IWF9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC83Q8IWF9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC83Q8IWF9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC83Q8IWF9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC83Q8IWF9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC83Q8IWF9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC83Q8IWF9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC83Q8IWF9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC83Q8IWF9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC83Q8IWF9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC83Q8IWF9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC83Q8IWF9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC83Q8IWF9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC83Q8IWF9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC83Q8IWF9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC83Q8IWF9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms