Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIX1LQ8IVB5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LIX1LQ8IVB5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIX1LQ8IVB5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIX1LQ8IVB5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIX1LQ8IVB5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIX1LQ8IVB5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIX1LQ8IVB5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIX1LQ8IVB5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIX1LQ8IVB5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIX1LQ8IVB5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIX1LQ8IVB5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIX1LQ8IVB5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIX1LQ8IVB5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIX1LQ8IVB5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIX1LQ8IVB5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIX1LQ8IVB5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIX1LQ8IVB5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms