RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.2■■■■■ 8.03
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCC9O60706 1549 aa58.14■■■■■ 6.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.48■■■■■ 6.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NACADO15069 1562 aa55.15■■■■■ 6.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.96■■■■■ 6.39
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.48■■■■■ 6.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.27■■■■■ 6.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.19■■■■■ 6.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.18■■■■■ 6.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.09■■■■■ 6.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.88■■■■■ 6.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.82■■■■■ 6.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCRIBQ14160 1630 aa53.23■■■■■ 6.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.15■■■■■ 6.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.53■■■■■ 6
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.35■■■■■ 5.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCAPD3P42695 1498 aa50.91■■■■■ 5.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMARCA4P51532 1647 aa50.81■■■■■ 5.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.78■■■■■ 5.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMARCA2P51531 1590 aa50.68■■■■■ 5.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.61■■■■■ 5.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMGXB3Q12766 1538 aa50.56■■■■■ 5.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.33■■■■■ 5.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.31■■■■■ 5.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.24■■■■■ 5.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERCC6Q03468 1493 aa50.2■■■■■ 5.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NESP48681 1621 aa50.01■■■■■ 5.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CUX2O14529 1486 aa50.01■■■■■ 5.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.73■■■■■ 5.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.67■■■■■ 5.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WIZO95785 1651 aa49.65■■■■■ 5.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.45■■■■■ 5.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.45■■■■■ 5.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.38■■■■■ 5.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.38■■■■■ 5.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.3■■■■■ 5.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.06■■■■■ 5.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.99■■■■■ 5.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFTRP13569 1480 aa48.86■■■■■ 5.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.86■■■■■ 5.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR62O43379 1518 aa48.85■■■■■ 5.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.82■■■■■ 5.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.49■■■■■ 5.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRDM2Q13029 1718 aa48.4■■■■■ 5.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.39■■■■■ 5.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOPBP1Q92547 1522 aa47.92■■■■■ 5.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFT140Q96RY7 1462 aa47.87■■■■■ 5.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCC8Q09428 1581 aa47.87■■■■■ 5.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSCARQ8IYS5 282 aa47.79■■■■■ 5.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.78■■■■■ 5.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.75■■■■■ 5.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM41Q8WV44 630 aa47.62■■■■■ 5.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.51■■■■■ 5.2
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.45■■■■■ 5.19
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.35■■■■■ 5.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.27■■■■■ 5.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOGA1O94964 1423 aa47.26■■■■■ 5.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.2■■■■■ 5.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CUX1P39880 1505 aa47.19■■■■■ 5.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.12■■■■■ 5.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.11■■■■■ 5.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.11■■■■■ 5.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.11■■■■■ 5.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHD1O14646 1710 aa47.1■■■■■ 5.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBLN2P98095 1184 aa47.03■■■■■ 5.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR97A6NE52 1622 aa47.03■■■■■ 5.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF11O15085 1522 aa47■■■■■ 5.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.89■■■■■ 5.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRIN2BQ13224 1484 aa46.82■■■■■ 5.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.79■■■■■ 5.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.73■■■■■ 5.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.69■■■■■ 5.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.68■■■■■ 5.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.65■■■■■ 5.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PBRM1Q86U86 1689 aa46.64■■■■■ 5.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYNJ2O15056 1496 aa46.63■■■■■ 5.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYNJ1O43426 1573 aa46.59■■■■■ 5.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.57■■■■■ 5.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.57■■■■■ 5.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.56■■■■■ 5.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARAP1Q96P48 1450 aa46.55■■■■■ 5.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOP2BQ02880 1626 aa46.51■■■■■ 5.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.51■■■■■ 5.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRIN2AQ12879 1464 aa46.21■■■■■ 4.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTS12P58397 1594 aa46.21■■■■■ 4.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.11■■■■■ 4.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.1■■■■■ 4.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUP160Q12769 1436 aa46.03■■■■■ 4.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP170Q5SW79 1584 aa46.02■■■■■ 4.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.85■■■■■ 4.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHROOM2Q13796 1616 aa45.8■■■■■ 4.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF27Q86VH2 1401 aa45.64■■■■■ 4.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JPH4Q96JJ6 628 aa45.58■■■■■ 4.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGF1RP08069 1367 aa45.57■■■■■ 4.88
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