RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454388.1

AL662864.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AL662864.1, Length 1,167 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL662864.1-201ENST00000454388 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.92■■■■■ 7.98
AL662864.1-201ENST00000454388 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.14■■■■■ 6.9
AL662864.1-201ENST00000454388 ABCC9O60706 1549 aa57.75■■■■■ 6.83
AL662864.1-201ENST00000454388 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.17■■■■■ 6.42
AL662864.1-201ENST00000454388 NACADO15069 1562 aa54.86■■■■■ 6.37
AL662864.1-201ENST00000454388 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.71■■■■■ 6.35
AL662864.1-201ENST00000454388 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.2■■■■■ 6.27
AL662864.1-201ENST00000454388 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.9■■■■■ 6.22
AL662864.1-201ENST00000454388 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.89■■■■■ 6.22
AL662864.1-201ENST00000454388 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.81■■■■■ 6.2
AL662864.1-201ENST00000454388 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.73■■■■■ 6.19
AL662864.1-201ENST00000454388 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.65■■■■■ 6.18
AL662864.1-201ENST00000454388 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.46■■■■■ 6.15
AL662864.1-201ENST00000454388 SCRIBQ14160 1630 aa53■■■■■ 6.08
AL662864.1-201ENST00000454388 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.86■■■■■ 6.05
AL662864.1-201ENST00000454388 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.18■■■■■ 5.94
AL662864.1-201ENST00000454388 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.17■■■■■ 5.94
AL662864.1-201ENST00000454388 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.99■■■■■ 5.91
AL662864.1-201ENST00000454388 NCAPD3P42695 1498 aa50.6■■■■■ 5.69
AL662864.1-201ENST00000454388 SMARCA4P51532 1647 aa50.58■■■■■ 5.69
AL662864.1-201ENST00000454388 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.51■■■■■ 5.68
AL662864.1-201ENST00000454388 SMARCA2P51531 1590 aa50.45■■■■■ 5.67
AL662864.1-201ENST00000454388 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.41■■■■■ 5.66
AL662864.1-201ENST00000454388 HMGXB3Q12766 1538 aa50.3■■■■■ 5.64
AL662864.1-201ENST00000454388 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.09■■■■■ 5.61
AL662864.1-201ENST00000454388 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.06■■■■■ 5.6
AL662864.1-201ENST00000454388 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.02■■■■■ 5.6
AL662864.1-201ENST00000454388 ERCC6Q03468 1493 aa49.89■■■■■ 5.58
AL662864.1-201ENST00000454388 NESP48681 1621 aa49.69■■■■■ 5.55
AL662864.1-201ENST00000454388 CUX2O14529 1486 aa49.63■■■■■ 5.53
AL662864.1-201ENST00000454388 WIZO95785 1651 aa49.46■■■■■ 5.51
AL662864.1-201ENST00000454388 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.45■■■■■ 5.51
AL662864.1-201ENST00000454388 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.17■■■■■ 5.46
AL662864.1-201ENST00000454388 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.12■■■■■ 5.45
AL662864.1-201ENST00000454388 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.12■■■■■ 5.45
AL662864.1-201ENST00000454388 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.12■■■■■ 5.45
AL662864.1-201ENST00000454388 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.11■■■■■ 5.45
AL662864.1-201ENST00000454388 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.1■■■■■ 5.45
AL662864.1-201ENST00000454388 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.88■■■■■ 5.41
AL662864.1-201ENST00000454388 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.7■■■■■ 5.39
AL662864.1-201ENST00000454388 CFTRP13569 1480 aa48.61■■■■■ 5.37
AL662864.1-201ENST00000454388 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.61■■■■■ 5.37
AL662864.1-201ENST00000454388 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.56■■■■■ 5.36
AL662864.1-201ENST00000454388 WDR62O43379 1518 aa48.55■■■■■ 5.36
AL662864.1-201ENST00000454388 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.29■■■■■ 5.32
AL662864.1-201ENST00000454388 PRDM2Q13029 1718 aa48.24■■■■■ 5.31
AL662864.1-201ENST00000454388 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.11■■■■■ 5.29
AL662864.1-201ENST00000454388 TOPBP1Q92547 1522 aa47.68■■■■■ 5.22
AL662864.1-201ENST00000454388 ABCC8Q09428 1581 aa47.65■■■■■ 5.22
AL662864.1-201ENST00000454388 IFT140Q96RY7 1462 aa47.61■■■■■ 5.21
AL662864.1-201ENST00000454388 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.56■■■■■ 5.2
AL662864.1-201ENST00000454388 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.45■■■■■ 5.19
AL662864.1-201ENST00000454388 OSCARQ8IYS5 282 aa47.43■■■■■ 5.18
AL662864.1-201ENST00000454388 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
AL662864.1-201ENST00000454388 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.25■■■■■ 5.15
AL662864.1-201ENST00000454388 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.21■■■■■ 5.15
AL662864.1-201ENST00000454388 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
AL662864.1-201ENST00000454388 TRIM41Q8WV44 630 aa47.2■■■■■ 5.15
AL662864.1-201ENST00000454388 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.08■■■■■ 5.13
AL662864.1-201ENST00000454388 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.02■■■■■ 5.12
AL662864.1-201ENST00000454388 SOGA1O94964 1423 aa47.02■■■■■ 5.12
AL662864.1-201ENST00000454388 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.98■■■■■ 5.11
AL662864.1-201ENST00000454388 CUX1P39880 1505 aa46.98■■■■■ 5.11
AL662864.1-201ENST00000454388 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
AL662864.1-201ENST00000454388 CHD1O14646 1710 aa46.85■■■■■ 5.09
AL662864.1-201ENST00000454388 WDR97A6NE52 1622 aa46.81■■■■■ 5.08
AL662864.1-201ENST00000454388 FBLN2P98095 1184 aa46.78■■■■■ 5.08
AL662864.1-201ENST00000454388 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.76■■■■■ 5.08
AL662864.1-201ENST00000454388 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.76■■■■■ 5.08
AL662864.1-201ENST00000454388 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.76■■■■■ 5.08
AL662864.1-201ENST00000454388 ARHGEF11O15085 1522 aa46.65■■■■■ 5.06
AL662864.1-201ENST00000454388 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.64■■■■■ 5.06
AL662864.1-201ENST00000454388 GRIN2BQ13224 1484 aa46.58■■■■■ 5.05
AL662864.1-201ENST00000454388 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.55■■■■■ 5.04
AL662864.1-201ENST00000454388 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.48■■■■■ 5.03
AL662864.1-201ENST00000454388 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.47■■■■■ 5.03
AL662864.1-201ENST00000454388 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.46■■■■■ 5.03
AL662864.1-201ENST00000454388 PBRM1Q86U86 1689 aa46.45■■■■■ 5.03
AL662864.1-201ENST00000454388 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.38■■■■■ 5.02
AL662864.1-201ENST00000454388 SYNJ2O15056 1496 aa46.38■■■■■ 5.01
AL662864.1-201ENST00000454388 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.36■■■■■ 5.01
AL662864.1-201ENST00000454388 TOP2BQ02880 1626 aa46.36■■■■■ 5.01
AL662864.1-201ENST00000454388 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.36■■■■■ 5.01
AL662864.1-201ENST00000454388 SYNJ1O43426 1573 aa46.35■■■■■ 5.01
AL662864.1-201ENST00000454388 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.3■■■■■ 5
AL662864.1-201ENST00000454388 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.27■■■■■ 5
AL662864.1-201ENST00000454388 ARAP1Q96P48 1450 aa46.2■■■■■ 4.99
AL662864.1-201ENST00000454388 ADAMTS12P58397 1594 aa46.01■■■■■ 4.96
AL662864.1-201ENST00000454388 GRIN2AQ12879 1464 aa45.97■■■■■ 4.95
AL662864.1-201ENST00000454388 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.91■■■■■ 4.94
AL662864.1-201ENST00000454388 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.89■■■■■ 4.94
AL662864.1-201ENST00000454388 CEP170Q5SW79 1584 aa45.78■■■■■ 4.92
AL662864.1-201ENST00000454388 NUP160Q12769 1436 aa45.77■■■■■ 4.92
AL662864.1-201ENST00000454388 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.72■■■■■ 4.91
AL662864.1-201ENST00000454388 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.56■■■■■ 4.88
AL662864.1-201ENST00000454388 SHROOM2Q13796 1616 aa45.54■■■■■ 4.88
AL662864.1-201ENST00000454388 KIF27Q86VH2 1401 aa45.5■■■■■ 4.87
AL662864.1-201ENST00000454388 IGF1RP08069 1367 aa45.36■■■■■ 4.85
AL662864.1-201ENST00000454388 CUL7Q14999 1698 aa45.35■■■■■ 4.85
AL662864.1-201ENST00000454388 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.34■■■■■ 4.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms