RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579129.5

MBP-237, Transcript of myelin basic protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MBP, Length 1,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBP-237ENST00000579129 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65■■■■■ 8
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MBP-237ENST00000579129 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.92■■■■■ 6.54
MBP-237ENST00000579129 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.86■■■■■ 6.53
MBP-237ENST00000579129 NACADO15069 1562 aa55.41■■■■■ 6.46
MBP-237ENST00000579129 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.26■■■■■ 6.44
MBP-237ENST00000579129 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.99■■■■■ 6.39
MBP-237ENST00000579129 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.56■■■■■ 6.33
MBP-237ENST00000579129 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.45■■■■■ 6.31
MBP-237ENST00000579129 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.31■■■■■ 6.28
MBP-237ENST00000579129 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.77■■■■■ 6.2
MBP-237ENST00000579129 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.6■■■■■ 6.17
MBP-237ENST00000579129 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.47■■■■■ 6.15
MBP-237ENST00000579129 SCRIBQ14160 1630 aa53.33■■■■■ 6.13
MBP-237ENST00000579129 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.26■■■■■ 6.12
MBP-237ENST00000579129 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.24■■■■■ 6.11
MBP-237ENST00000579129 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.03■■■■■ 6.08
MBP-237ENST00000579129 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.6■■■■■ 5.85
MBP-237ENST00000579129 NCAPD3P42695 1498 aa51.2■■■■■ 5.79
MBP-237ENST00000579129 CUX2O14529 1486 aa51.03■■■■■ 5.76
MBP-237ENST00000579129 ERCC6Q03468 1493 aa51.03■■■■■ 5.76
MBP-237ENST00000579129 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51■■■■■ 5.75
MBP-237ENST00000579129 SMARCA2P51531 1590 aa50.79■■■■■ 5.72
MBP-237ENST00000579129 SMARCA4P51532 1647 aa50.78■■■■■ 5.72
MBP-237ENST00000579129 HMGXB3Q12766 1538 aa50.73■■■■■ 5.71
MBP-237ENST00000579129 NESP48681 1621 aa50.6■■■■■ 5.69
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MBP-237ENST00000579129 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.47■■■■■ 5.67
MBP-237ENST00000579129 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.26■■■■■ 5.64
MBP-237ENST00000579129 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.11■■■■■ 5.61
MBP-237ENST00000579129 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.09■■■■■ 5.61
MBP-237ENST00000579129 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.08■■■■■ 5.61
MBP-237ENST00000579129 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.87■■■■■ 5.57
MBP-237ENST00000579129 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.83■■■■■ 5.57
MBP-237ENST00000579129 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.66■■■■■ 5.54
MBP-237ENST00000579129 WIZO95785 1651 aa49.46■■■■■ 5.51
MBP-237ENST00000579129 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.46■■■■■ 5.51
MBP-237ENST00000579129 WDR62O43379 1518 aa49.32■■■■■ 5.49
MBP-237ENST00000579129 TRIM41Q8WV44 630 aa49.24■■■■■ 5.47
MBP-237ENST00000579129 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.18■■■■■ 5.46
MBP-237ENST00000579129 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.1■■■■■ 5.45
MBP-237ENST00000579129 CFTRP13569 1480 aa48.97■■■■■ 5.43
MBP-237ENST00000579129 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.92■■■■■ 5.42
MBP-237ENST00000579129 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.8■■■■■ 5.4
MBP-237ENST00000579129 OSCARQ8IYS5 282 aa48.71■■■■■ 5.39
MBP-237ENST00000579129 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
MBP-237ENST00000579129 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.29■■■■■ 5.32
MBP-237ENST00000579129 PRDM2Q13029 1718 aa48.28■■■■■ 5.32
MBP-237ENST00000579129 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.22■■■■■ 5.31
MBP-237ENST00000579129 IFT140Q96RY7 1462 aa48.21■■■■■ 5.31
MBP-237ENST00000579129 TOPBP1Q92547 1522 aa48.1■■■■■ 5.29
MBP-237ENST00000579129 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.04■■■■■ 5.28
MBP-237ENST00000579129 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.04■■■■■ 5.28
MBP-237ENST00000579129 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.04■■■■■ 5.28
MBP-237ENST00000579129 ABCC8Q09428 1581 aa47.92■■■■■ 5.26
MBP-237ENST00000579129 ARHGEF11O15085 1522 aa47.86■■■■■ 5.25
MBP-237ENST00000579129 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
MBP-237ENST00000579129 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.84■■■■■ 5.25
MBP-237ENST00000579129 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.74■■■■■ 5.23
MBP-237ENST00000579129 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
MBP-237ENST00000579129 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.65■■■■■ 5.22
MBP-237ENST00000579129 FBLN2P98095 1184 aa47.59■■■■■ 5.21
MBP-237ENST00000579129 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.59■■■■■ 5.21
MBP-237ENST00000579129 CHD1O14646 1710 aa47.56■■■■■ 5.2
MBP-237ENST00000579129 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.46■■■■■ 5.19
MBP-237ENST00000579129 SOGA1O94964 1423 aa47.39■■■■■ 5.18
MBP-237ENST00000579129 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.39■■■■■ 5.18
MBP-237ENST00000579129 ARAP1Q96P48 1450 aa47.38■■■■■ 5.17
MBP-237ENST00000579129 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.29■■■■■ 5.16
MBP-237ENST00000579129 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.23■■■■■ 5.15
MBP-237ENST00000579129 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.21■■■■■ 5.15
MBP-237ENST00000579129 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.13■■■■■ 5.14
MBP-237ENST00000579129 CUX1P39880 1505 aa47.1■■■■■ 5.13
MBP-237ENST00000579129 WDR97A6NE52 1622 aa47.09■■■■■ 5.13
MBP-237ENST00000579129 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.03■■■■■ 5.12
MBP-237ENST00000579129 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.02■■■■■ 5.12
MBP-237ENST00000579129 GRIN2BQ13224 1484 aa47.01■■■■■ 5.12
MBP-237ENST00000579129 SYNJ1O43426 1573 aa46.98■■■■■ 5.11
MBP-237ENST00000579129 SYNJ2O15056 1496 aa46.89■■■■■ 5.1
MBP-237ENST00000579129 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.78■■■■■ 5.08
MBP-237ENST00000579129 PBRM1Q86U86 1689 aa46.7■■■■■ 5.07
MBP-237ENST00000579129 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.64■■■■■ 5.06
MBP-237ENST00000579129 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.57■■■■■ 5.05
MBP-237ENST00000579129 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.53■■■■■ 5.04
MBP-237ENST00000579129 GRIN2AQ12879 1464 aa46.39■■■■■ 5.02
MBP-237ENST00000579129 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.39■■■■■ 5.02
MBP-237ENST00000579129 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.32■■■■■ 5.01
MBP-237ENST00000579129 ADAMTS12P58397 1594 aa46.27■■■■■ 5
MBP-237ENST00000579129 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.25■■■■■ 4.99
MBP-237ENST00000579129 NUP160Q12769 1436 aa46.25■■■■■ 4.99
MBP-237ENST00000579129 CEP170Q5SW79 1584 aa46.24■■■■■ 4.99
MBP-237ENST00000579129 TOP2BQ02880 1626 aa46.17■■■■■ 4.98
MBP-237ENST00000579129 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.17■■■■■ 4.98
MBP-237ENST00000579129 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.15■■■■■ 4.98
MBP-237ENST00000579129 SHROOM2Q13796 1616 aa46.03■■■■■ 4.96
MBP-237ENST00000579129 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.02■■■■■ 4.96
MBP-237ENST00000579129 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
MBP-237ENST00000579129 JPH4Q96JJ6 628 aa45.85■■■■■ 4.93
MBP-237ENST00000579129 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.64■■■■■ 4.9
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