Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HCC1LQ7Z5L2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HCC1LQ7Z5L2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HCC1LQ7Z5L2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1LQ7Z5L2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HCC1LQ7Z5L2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HCC1LQ7Z5L2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HCC1LQ7Z5L2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HCC1LQ7Z5L2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1LQ7Z5L2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1LQ7Z5L2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HCC1LQ7Z5L2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1LQ7Z5L2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1LQ7Z5L2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1LQ7Z5L2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1LQ7Z5L2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
R3HCC1LQ7Z5L2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HCC1LQ7Z5L2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HCC1LQ7Z5L2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
R3HCC1LQ7Z5L2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HCC1LQ7Z5L2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HCC1LQ7Z5L2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HCC1LQ7Z5L2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HCC1LQ7Z5L2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HCC1LQ7Z5L2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HCC1LQ7Z5L2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HCC1LQ7Z5L2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HCC1LQ7Z5L2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HCC1LQ7Z5L2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HCC1LQ7Z5L2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HCC1LQ7Z5L2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HCC1LQ7Z5L2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3HCC1LQ7Z5L2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms