Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CROCCQ5TZA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CROCCQ5TZA2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CROCCQ5TZA2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CROCCQ5TZA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CROCCQ5TZA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CROCCQ5TZA2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CROCCQ5TZA2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CROCCQ5TZA2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CROCCQ5TZA2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CROCCQ5TZA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CROCCQ5TZA2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CROCCQ5TZA2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CROCCQ5TZA2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CROCCQ5TZA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CROCCQ5TZA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CROCCQ5TZA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CROCCQ5TZA2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CROCCQ5TZA2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CROCCQ5TZA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CROCCQ5TZA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CROCCQ5TZA2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CROCCQ5TZA2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CROCCQ5TZA2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CROCCQ5TZA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms