RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523608.2

AC004080.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC004080.1, Length 757 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004080.1-201ENST00000523608 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.04■■■■■ 8.32
AC004080.1-201ENST00000523608 ABCC9O60706 1549 aa59.88■■■■■ 7.18
AC004080.1-201ENST00000523608 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.87■■■■■ 7.17
AC004080.1-201ENST00000523608 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.91■■■■■ 6.7
AC004080.1-201ENST00000523608 NACADO15069 1562 aa56.59■■■■■ 6.65
AC004080.1-201ENST00000523608 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.56■■■■■ 6.64
AC004080.1-201ENST00000523608 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.13■■■■■ 6.58
AC004080.1-201ENST00000523608 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.88■■■■■ 6.54
AC004080.1-201ENST00000523608 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.86■■■■■ 6.53
AC004080.1-201ENST00000523608 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.71■■■■■ 6.51
AC004080.1-201ENST00000523608 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.61■■■■■ 6.49
AC004080.1-201ENST00000523608 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.43■■■■■ 6.46
AC004080.1-201ENST00000523608 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.27■■■■■ 6.44
AC004080.1-201ENST00000523608 SCRIBQ14160 1630 aa54.76■■■■■ 6.36
AC004080.1-201ENST00000523608 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.41■■■■■ 6.3
AC004080.1-201ENST00000523608 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.03■■■■■ 6.24
AC004080.1-201ENST00000523608 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.95■■■■■ 6.23
AC004080.1-201ENST00000523608 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.84■■■■■ 6.21
AC004080.1-201ENST00000523608 NCAPD3P42695 1498 aa52.33■■■■■ 5.97
AC004080.1-201ENST00000523608 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.25■■■■■ 5.96
AC004080.1-201ENST00000523608 SMARCA4P51532 1647 aa52.21■■■■■ 5.95
AC004080.1-201ENST00000523608 SMARCA2P51531 1590 aa51.98■■■■■ 5.91
AC004080.1-201ENST00000523608 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.92■■■■■ 5.9
AC004080.1-201ENST00000523608 HMGXB3Q12766 1538 aa51.89■■■■■ 5.9
AC004080.1-201ENST00000523608 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.74■■■■■ 5.87
AC004080.1-201ENST00000523608 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.68■■■■■ 5.86
AC004080.1-201ENST00000523608 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.66■■■■■ 5.86
AC004080.1-201ENST00000523608 NESP48681 1621 aa51.56■■■■■ 5.85
AC004080.1-201ENST00000523608 ERCC6Q03468 1493 aa51.54■■■■■ 5.84
AC004080.1-201ENST00000523608 CUX2O14529 1486 aa51.32■■■■■ 5.81
AC004080.1-201ENST00000523608 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.15■■■■■ 5.78
AC004080.1-201ENST00000523608 WIZO95785 1651 aa51.1■■■■■ 5.77
AC004080.1-201ENST00000523608 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.01■■■■■ 5.76
AC004080.1-201ENST00000523608 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.85■■■■■ 5.73
AC004080.1-201ENST00000523608 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.77■■■■■ 5.72
AC004080.1-201ENST00000523608 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.77■■■■■ 5.72
AC004080.1-201ENST00000523608 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.75■■■■■ 5.71
AC004080.1-201ENST00000523608 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.73■■■■■ 5.71
AC004080.1-201ENST00000523608 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.39■■■■■ 5.66
AC004080.1-201ENST00000523608 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.33■■■■■ 5.65
AC004080.1-201ENST00000523608 CFTRP13569 1480 aa50.23■■■■■ 5.63
AC004080.1-201ENST00000523608 WDR62O43379 1518 aa50.2■■■■■ 5.63
AC004080.1-201ENST00000523608 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.19■■■■■ 5.62
AC004080.1-201ENST00000523608 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.15■■■■■ 5.62
AC004080.1-201ENST00000523608 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.92■■■■■ 5.58
AC004080.1-201ENST00000523608 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.82■■■■■ 5.57
AC004080.1-201ENST00000523608 PRDM2Q13029 1718 aa49.58■■■■■ 5.53
AC004080.1-201ENST00000523608 TOPBP1Q92547 1522 aa49.29■■■■■ 5.48
AC004080.1-201ENST00000523608 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.21■■■■■ 5.47
AC004080.1-201ENST00000523608 IFT140Q96RY7 1462 aa49.15■■■■■ 5.46
AC004080.1-201ENST00000523608 OSCARQ8IYS5 282 aa49.1■■■■■ 5.45
AC004080.1-201ENST00000523608 TRIM41Q8WV44 630 aa49.06■■■■■ 5.44
AC004080.1-201ENST00000523608 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.06■■■■■ 5.44
AC004080.1-201ENST00000523608 ABCC8Q09428 1581 aa49.02■■■■■ 5.44
AC004080.1-201ENST00000523608 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.82■■■■■ 5.41
AC004080.1-201ENST00000523608 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.81■■■■■ 5.4
AC004080.1-201ENST00000523608 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.8■■■■■ 5.4
AC004080.1-201ENST00000523608 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.79■■■■■ 5.4
AC004080.1-201ENST00000523608 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.76■■■■■ 5.4
AC004080.1-201ENST00000523608 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.72■■■■■ 5.39
AC004080.1-201ENST00000523608 SOGA1O94964 1423 aa48.58■■■■■ 5.37
AC004080.1-201ENST00000523608 CUX1P39880 1505 aa48.58■■■■■ 5.37
AC004080.1-201ENST00000523608 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.54■■■■■ 5.36
AC004080.1-201ENST00000523608 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.53■■■■■ 5.36
AC004080.1-201ENST00000523608 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.46■■■■■ 5.35
AC004080.1-201ENST00000523608 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.46■■■■■ 5.35
AC004080.1-201ENST00000523608 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.46■■■■■ 5.35
AC004080.1-201ENST00000523608 CHD1O14646 1710 aa48.41■■■■■ 5.34
AC004080.1-201ENST00000523608 FBLN2P98095 1184 aa48.36■■■■■ 5.33
AC004080.1-201ENST00000523608 ARHGEF11O15085 1522 aa48.33■■■■■ 5.33
AC004080.1-201ENST00000523608 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.23■■■■■ 5.31
AC004080.1-201ENST00000523608 WDR97A6NE52 1622 aa48.13■■■■■ 5.3
AC004080.1-201ENST00000523608 GRIN2BQ13224 1484 aa48.07■■■■■ 5.29
AC004080.1-201ENST00000523608 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.03■■■■■ 5.28
AC004080.1-201ENST00000523608 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48■■■■■ 5.27
AC004080.1-201ENST00000523608 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.99■■■■■ 5.27
AC004080.1-201ENST00000523608 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.97■■■■■ 5.27
AC004080.1-201ENST00000523608 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.96■■■■■ 5.27
AC004080.1-201ENST00000523608 ARAP1Q96P48 1450 aa47.93■■■■■ 5.26
AC004080.1-201ENST00000523608 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.89■■■■■ 5.26
AC004080.1-201ENST00000523608 SYNJ2O15056 1496 aa47.88■■■■■ 5.26
AC004080.1-201ENST00000523608 PBRM1Q86U86 1689 aa47.87■■■■■ 5.25
AC004080.1-201ENST00000523608 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.85■■■■■ 5.25
AC004080.1-201ENST00000523608 SYNJ1O43426 1573 aa47.81■■■■■ 5.24
AC004080.1-201ENST00000523608 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.8■■■■■ 5.24
AC004080.1-201ENST00000523608 TOP2BQ02880 1626 aa47.76■■■■■ 5.24
AC004080.1-201ENST00000523608 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.75■■■■■ 5.23
AC004080.1-201ENST00000523608 GRIN2AQ12879 1464 aa47.48■■■■■ 5.19
AC004080.1-201ENST00000523608 ADAMTS12P58397 1594 aa47.48■■■■■ 5.19
AC004080.1-201ENST00000523608 CEP170Q5SW79 1584 aa47.36■■■■■ 5.17
AC004080.1-201ENST00000523608 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.35■■■■■ 5.17
AC004080.1-201ENST00000523608 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.35■■■■■ 5.17
AC004080.1-201ENST00000523608 NUP160Q12769 1436 aa47.33■■■■■ 5.17
AC004080.1-201ENST00000523608 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.31■■■■■ 5.16
AC004080.1-201ENST00000523608 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.3■■■■■ 5.16
AC004080.1-201ENST00000523608 SHROOM2Q13796 1616 aa47.05■■■■■ 5.12
AC004080.1-201ENST00000523608 IGF1RP08069 1367 aa46.92■■■■■ 5.1
AC004080.1-201ENST00000523608 JPH4Q96JJ6 628 aa46.88■■■■■ 5.1
AC004080.1-201ENST00000523608 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.88■■■■■ 5.09
AC004080.1-201ENST00000523608 KIF27Q86VH2 1401 aa46.83■■■■■ 5.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms