RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615007.4

LYNX1-208, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYNX1, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1-208ENST00000615007 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.11■■■■■ 8.33
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LYNX1-208ENST00000615007 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.03■■■■■ 6.72
LYNX1-208ENST00000615007 NACADO15069 1562 aa56.74■■■■■ 6.67
LYNX1-208ENST00000615007 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.35■■■■■ 6.61
LYNX1-208ENST00000615007 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.12■■■■■ 6.57
LYNX1-208ENST00000615007 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.74■■■■■ 6.51
LYNX1-208ENST00000615007 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.71■■■■■ 6.51
LYNX1-208ENST00000615007 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.54■■■■■ 6.48
LYNX1-208ENST00000615007 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.43■■■■■ 6.46
LYNX1-208ENST00000615007 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.32■■■■■ 6.45
LYNX1-208ENST00000615007 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.23■■■■■ 6.43
LYNX1-208ENST00000615007 SCRIBQ14160 1630 aa54.73■■■■■ 6.35
LYNX1-208ENST00000615007 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.73■■■■■ 6.35
LYNX1-208ENST00000615007 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.9■■■■■ 6.22
LYNX1-208ENST00000615007 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.89■■■■■ 6.22
LYNX1-208ENST00000615007 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.65■■■■■ 6.18
LYNX1-208ENST00000615007 SMARCA4P51532 1647 aa52.3■■■■■ 5.96
LYNX1-208ENST00000615007 NCAPD3P42695 1498 aa52.3■■■■■ 5.96
LYNX1-208ENST00000615007 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.18■■■■■ 5.94
LYNX1-208ENST00000615007 SMARCA2P51531 1590 aa52.17■■■■■ 5.94
LYNX1-208ENST00000615007 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.14■■■■■ 5.94
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LYNX1-208ENST00000615007 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.75■■■■■ 5.88
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LYNX1-208ENST00000615007 ERCC6Q03468 1493 aa51.49■■■■■ 5.83
LYNX1-208ENST00000615007 CUX2O14529 1486 aa51.29■■■■■ 5.8
LYNX1-208ENST00000615007 NESP48681 1621 aa51.26■■■■■ 5.8
LYNX1-208ENST00000615007 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.14■■■■■ 5.78
LYNX1-208ENST00000615007 WIZO95785 1651 aa51.1■■■■■ 5.77
LYNX1-208ENST00000615007 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.79■■■■■ 5.72
LYNX1-208ENST00000615007 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.77■■■■■ 5.72
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LYNX1-208ENST00000615007 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.71■■■■■ 5.71
LYNX1-208ENST00000615007 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.61■■■■■ 5.69
LYNX1-208ENST00000615007 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.55■■■■■ 5.68
LYNX1-208ENST00000615007 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.31■■■■■ 5.64
LYNX1-208ENST00000615007 CFTRP13569 1480 aa50.25■■■■■ 5.63
LYNX1-208ENST00000615007 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.22■■■■■ 5.63
LYNX1-208ENST00000615007 WDR62O43379 1518 aa50.18■■■■■ 5.62
LYNX1-208ENST00000615007 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.16■■■■■ 5.62
LYNX1-208ENST00000615007 PRDM2Q13029 1718 aa49.95■■■■■ 5.59
LYNX1-208ENST00000615007 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.88■■■■■ 5.57
LYNX1-208ENST00000615007 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.68■■■■■ 5.54
LYNX1-208ENST00000615007 ABCC8Q09428 1581 aa49.28■■■■■ 5.48
LYNX1-208ENST00000615007 TOPBP1Q92547 1522 aa49.25■■■■■ 5.48
LYNX1-208ENST00000615007 IFT140Q96RY7 1462 aa49.19■■■■■ 5.47
LYNX1-208ENST00000615007 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.17■■■■■ 5.46
LYNX1-208ENST00000615007 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.96■■■■■ 5.43
LYNX1-208ENST00000615007 OSCARQ8IYS5 282 aa48.92■■■■■ 5.42
LYNX1-208ENST00000615007 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.83■■■■■ 5.41
LYNX1-208ENST00000615007 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.8■■■■■ 5.4
LYNX1-208ENST00000615007 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.78■■■■■ 5.4
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LYNX1-208ENST00000615007 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.54■■■■■ 5.36
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LYNX1-208ENST00000615007 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.52■■■■■ 5.36
LYNX1-208ENST00000615007 WDR97A6NE52 1622 aa48.48■■■■■ 5.35
LYNX1-208ENST00000615007 CHD1O14646 1710 aa48.4■■■■■ 5.34
LYNX1-208ENST00000615007 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.33■■■■■ 5.33
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LYNX1-208ENST00000615007 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.28■■■■■ 5.32
LYNX1-208ENST00000615007 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.28■■■■■ 5.32
LYNX1-208ENST00000615007 FBLN2P98095 1184 aa48.19■■■■■ 5.3
LYNX1-208ENST00000615007 ARHGEF11O15085 1522 aa48.17■■■■■ 5.3
LYNX1-208ENST00000615007 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.16■■■■■ 5.3
LYNX1-208ENST00000615007 GRIN2BQ13224 1484 aa48.13■■■■■ 5.3
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LYNX1-208ENST00000615007 PBRM1Q86U86 1689 aa48.03■■■■■ 5.28
LYNX1-208ENST00000615007 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.99■■■■■ 5.27
LYNX1-208ENST00000615007 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.97■■■■■ 5.27
LYNX1-208ENST00000615007 TOP2BQ02880 1626 aa47.96■■■■■ 5.27
LYNX1-208ENST00000615007 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.96■■■■■ 5.27
LYNX1-208ENST00000615007 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.94■■■■■ 5.26
LYNX1-208ENST00000615007 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.93■■■■■ 5.26
LYNX1-208ENST00000615007 SYNJ2O15056 1496 aa47.92■■■■■ 5.26
LYNX1-208ENST00000615007 SYNJ1O43426 1573 aa47.91■■■■■ 5.26
LYNX1-208ENST00000615007 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.81■■■■■ 5.24
LYNX1-208ENST00000615007 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.69■■■■■ 5.22
LYNX1-208ENST00000615007 ARAP1Q96P48 1450 aa47.68■■■■■ 5.22
LYNX1-208ENST00000615007 ADAMTS12P58397 1594 aa47.56■■■■■ 5.2
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LYNX1-208ENST00000615007 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.49■■■■■ 5.19
LYNX1-208ENST00000615007 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.42■■■■■ 5.18
LYNX1-208ENST00000615007 NUP160Q12769 1436 aa47.3■■■■■ 5.16
LYNX1-208ENST00000615007 CEP170Q5SW79 1584 aa47.28■■■■■ 5.16
LYNX1-208ENST00000615007 SHROOM2Q13796 1616 aa47.1■■■■■ 5.13
LYNX1-208ENST00000615007 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.06■■■■■ 5.12
LYNX1-208ENST00000615007 KIF27Q86VH2 1401 aa47.02■■■■■ 5.12
LYNX1-208ENST00000615007 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.01■■■■■ 5.12
LYNX1-208ENST00000615007 CUL7Q14999 1698 aa46.94■■■■■ 5.1
LYNX1-208ENST00000615007 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.88■■■■■ 5.09
LYNX1-208ENST00000615007 IGF1RP08069 1367 aa46.84■■■■■ 5.09
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