Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
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