Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4Q12950 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4Q12950 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD4Q12950 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4Q12950 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4Q12950 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4Q12950 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4Q12950 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms