Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNH2Q12809 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH2Q12809 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNH2Q12809 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNH2Q12809 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNH2Q12809 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNH2Q12809 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNH2Q12809 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNH2Q12809 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNH2Q12809 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNH2Q12809 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNH2Q12809 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNH2Q12809 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNH2Q12809 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNH2Q12809 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KCNH2Q12809 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNH2Q12809 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNH2Q12809 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNH2Q12809 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNH2Q12809 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNH2Q12809 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNH2Q12809 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNH2Q12809 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNH2Q12809 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNH2Q12809 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNH2Q12809 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNH2Q12809 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNH2Q12809 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNH2Q12809 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNH2Q12809 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
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