Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REG3AQ06141 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REG3AQ06141 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG3AQ06141 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG3AQ06141 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG3AQ06141 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
REG3AQ06141 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG3AQ06141 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG3AQ06141 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG3AQ06141 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG3AQ06141 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
REG3AQ06141 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms