Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAE1P78406 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAE1P78406 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAE1P78406 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAE1P78406 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAE1P78406 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAE1P78406 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAE1P78406 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAE1P78406 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAE1P78406 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAE1P78406 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAE1P78406 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAE1P78406 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAE1P78406 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAE1P78406 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAE1P78406 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAE1P78406 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAE1P78406 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAE1P78406 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAE1P78406 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAE1P78406 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAE1P78406 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAE1P78406 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAE1P78406 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAE1P78406 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAE1P78406 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAE1P78406 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAE1P78406 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAE1P78406 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAE1P78406 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAE1P78406 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAE1P78406 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAE1P78406 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAE1P78406 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAE1P78406 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAE1P78406 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAE1P78406 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAE1P78406 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAE1P78406 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAE1P78406 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAE1P78406 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAE1P78406 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAE1P78406 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAE1P78406 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAE1P78406 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAE1P78406 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAE1P78406 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAE1P78406 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAE1P78406 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAE1P78406 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAE1P78406 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RAE1P78406 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAE1P78406 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAE1P78406 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAE1P78406 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAE1P78406 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAE1P78406 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAE1P78406 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAE1P78406 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAE1P78406 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAE1P78406 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAE1P78406 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAE1P78406 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAE1P78406 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAE1P78406 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAE1P78406 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAE1P78406 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAE1P78406 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAE1P78406 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAE1P78406 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAE1P78406 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAE1P78406 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAE1P78406 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAE1P78406 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAE1P78406 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAE1P78406 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAE1P78406 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAE1P78406 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAE1P78406 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAE1P78406 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAE1P78406 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAE1P78406 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAE1P78406 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAE1P78406 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAE1P78406 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAE1P78406 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAE1P78406 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAE1P78406 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAE1P78406 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAE1P78406 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAE1P78406 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAE1P78406 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAE1P78406 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAE1P78406 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAE1P78406 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAE1P78406 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAE1P78406 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAE1P78406 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAE1P78406 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAE1P78406 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms