Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRISP3P54108 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRISP3P54108 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRISP3P54108 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRISP3P54108 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CRISP3P54108 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRISP3P54108 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRISP3P54108 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRISP3P54108 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRISP3P54108 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRISP3P54108 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRISP3P54108 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRISP3P54108 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRISP3P54108 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRISP3P54108 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms