Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSK3AP49840 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSK3AP49840 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSK3AP49840 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSK3AP49840 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSK3AP49840 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GSK3AP49840 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSK3AP49840 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSK3AP49840 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSK3AP49840 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSK3AP49840 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSK3AP49840 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSK3AP49840 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSK3AP49840 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSK3AP49840 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSK3AP49840 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSK3AP49840 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3AP49840 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSK3AP49840 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms