Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GSK3AP49840 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GSK3AP49840 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GSK3AP49840 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GSK3AP49840 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSK3AP49840 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GSK3AP49840 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GSK3AP49840 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GSK3AP49840 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GSK3AP49840 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GSK3AP49840 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSK3AP49840 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GSK3AP49840 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSK3AP49840 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GSK3AP49840 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GSK3AP49840 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSK3AP49840 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GSK3AP49840 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSK3AP49840 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GSK3AP49840 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GSK3AP49840 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSK3AP49840 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GSK3AP49840 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSK3AP49840 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSK3AP49840 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSK3AP49840 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GSK3AP49840 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GSK3AP49840 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSK3AP49840 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSK3AP49840 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSK3AP49840 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSK3AP49840 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSK3AP49840 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSK3AP49840 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GSK3AP49840 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GSK3AP49840 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GSK3AP49840 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GSK3AP49840 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GSK3AP49840 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSK3AP49840 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GSK3AP49840 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GSK3AP49840 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSK3AP49840 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSK3AP49840 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSK3AP49840 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSK3AP49840 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSK3AP49840 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSK3AP49840 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSK3AP49840 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSK3AP49840 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSK3AP49840 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSK3AP49840 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSK3AP49840 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSK3AP49840 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSK3AP49840 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSK3AP49840 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSK3AP49840 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSK3AP49840 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSK3AP49840 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSK3AP49840 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSK3AP49840 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSK3AP49840 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSK3AP49840 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSK3AP49840 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSK3AP49840 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSK3AP49840 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSK3AP49840 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSK3AP49840 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSK3AP49840 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSK3AP49840 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSK3AP49840 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSK3AP49840 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSK3AP49840 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSK3AP49840 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSK3AP49840 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSK3AP49840 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSK3AP49840 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GSK3AP49840 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSK3AP49840 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSK3AP49840 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSK3AP49840 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSK3AP49840 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSK3AP49840 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSK3AP49840 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GSK3AP49840 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSK3AP49840 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSK3AP49840 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSK3AP49840 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSK3AP49840 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSK3AP49840 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSK3AP49840 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSK3AP49840 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSK3AP49840 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GSK3AP49840 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSK3AP49840 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSK3AP49840 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSK3AP49840 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSK3AP49840 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSK3AP49840 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSK3AP49840 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms