Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARL1P40616 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARL1P40616 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARL1P40616 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARL1P40616 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARL1P40616 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ARL1P40616 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARL1P40616 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARL1P40616 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARL1P40616 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARL1P40616 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARL1P40616 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARL1P40616 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARL1P40616 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARL1P40616 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARL1P40616 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARL1P40616 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARL1P40616 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARL1P40616 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARL1P40616 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARL1P40616 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARL1P40616 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARL1P40616 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARL1P40616 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARL1P40616 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARL1P40616 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARL1P40616 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARL1P40616 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARL1P40616 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARL1P40616 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARL1P40616 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARL1P40616 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARL1P40616 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARL1P40616 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARL1P40616 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARL1P40616 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARL1P40616 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARL1P40616 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARL1P40616 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARL1P40616 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARL1P40616 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARL1P40616 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARL1P40616 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARL1P40616 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARL1P40616 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARL1P40616 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARL1P40616 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARL1P40616 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARL1P40616 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARL1P40616 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARL1P40616 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARL1P40616 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARL1P40616 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ARL1P40616 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARL1P40616 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARL1P40616 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARL1P40616 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARL1P40616 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARL1P40616 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARL1P40616 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARL1P40616 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARL1P40616 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARL1P40616 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARL1P40616 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARL1P40616 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARL1P40616 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARL1P40616 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARL1P40616 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARL1P40616 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARL1P40616 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARL1P40616 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARL1P40616 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARL1P40616 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL1P40616 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL1P40616 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL1P40616 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARL1P40616 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARL1P40616 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARL1P40616 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL1P40616 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL1P40616 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL1P40616 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL1P40616 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL1P40616 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL1P40616 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL1P40616 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARL1P40616 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARL1P40616 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARL1P40616 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARL1P40616 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARL1P40616 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARL1P40616 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL1P40616 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL1P40616 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL1P40616 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL1P40616 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL1P40616 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL1P40616 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL1P40616 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL1P40616 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms