Protein–RNA interactions for Protein: P36873

PPP1CC, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CCP36873 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CCP36873 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CCP36873 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1CCP36873 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1CCP36873 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1CCP36873 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1CCP36873 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1CCP36873 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1CCP36873 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CCP36873 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CCP36873 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CCP36873 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CCP36873 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CCP36873 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CCP36873 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CCP36873 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1CCP36873 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1CCP36873 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1CCP36873 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1CCP36873 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CCP36873 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1CCP36873 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1CCP36873 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1CCP36873 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms