Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NMBRP28336 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NMBRP28336 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NMBRP28336 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NMBRP28336 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NMBRP28336 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NMBRP28336 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NMBRP28336 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NMBRP28336 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NMBRP28336 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NMBRP28336 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NMBRP28336 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NMBRP28336 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NMBRP28336 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NMBRP28336 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NMBRP28336 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NMBRP28336 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NMBRP28336 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NMBRP28336 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NMBRP28336 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NMBRP28336 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NMBRP28336 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NMBRP28336 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NMBRP28336 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NMBRP28336 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NMBRP28336 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NMBRP28336 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NMBRP28336 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NMBRP28336 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NMBRP28336 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NMBRP28336 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NMBRP28336 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NMBRP28336 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NMBRP28336 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NMBRP28336 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NMBRP28336 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NMBRP28336 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NMBRP28336 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NMBRP28336 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NMBRP28336 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NMBRP28336 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NMBRP28336 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NMBRP28336 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NMBRP28336 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NMBRP28336 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NMBRP28336 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NMBRP28336 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NMBRP28336 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NMBRP28336 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NMBRP28336 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NMBRP28336 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NMBRP28336 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NMBRP28336 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NMBRP28336 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NMBRP28336 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NMBRP28336 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NMBRP28336 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NMBRP28336 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NMBRP28336 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NMBRP28336 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NMBRP28336 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NMBRP28336 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NMBRP28336 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NMBRP28336 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NMBRP28336 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NMBRP28336 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NMBRP28336 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NMBRP28336 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NMBRP28336 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NMBRP28336 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NMBRP28336 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NMBRP28336 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NMBRP28336 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NMBRP28336 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NMBRP28336 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NMBRP28336 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NMBRP28336 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NMBRP28336 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NMBRP28336 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NMBRP28336 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NMBRP28336 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NMBRP28336 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NMBRP28336 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NMBRP28336 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NMBRP28336 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NMBRP28336 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NMBRP28336 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NMBRP28336 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NMBRP28336 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NMBRP28336 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NMBRP28336 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NMBRP28336 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NMBRP28336 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NMBRP28336 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NMBRP28336 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NMBRP28336 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NMBRP28336 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NMBRP28336 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NMBRP28336 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NMBRP28336 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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