Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYOD1P15172 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MYOD1P15172 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYOD1P15172 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYOD1P15172 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MYOD1P15172 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MYOD1P15172 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYOD1P15172 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MYOD1P15172 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYOD1P15172 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYOD1P15172 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYOD1P15172 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYOD1P15172 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYOD1P15172 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYOD1P15172 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYOD1P15172 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MYOD1P15172 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYOD1P15172 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYOD1P15172 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYOD1P15172 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYOD1P15172 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYOD1P15172 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYOD1P15172 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYOD1P15172 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYOD1P15172 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYOD1P15172 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MYOD1P15172 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYOD1P15172 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYOD1P15172 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYOD1P15172 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYOD1P15172 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MYOD1P15172 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MYOD1P15172 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYOD1P15172 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYOD1P15172 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms