Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRR29P0C7W0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRR29P0C7W0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRR29P0C7W0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRR29P0C7W0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRR29P0C7W0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms