Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PRR29P0C7W0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRR29P0C7W0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
PRR29P0C7W0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PRR29P0C7W0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRR29P0C7W0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
PRR29P0C7W0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRR29P0C7W0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRR29P0C7W0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRR29P0C7W0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PRR29P0C7W0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRR29P0C7W0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRR29P0C7W0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRR29P0C7W0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRR29P0C7W0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRR29P0C7W0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRR29P0C7W0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRR29P0C7W0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRR29P0C7W0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRR29P0C7W0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRR29P0C7W0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRR29P0C7W0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRR29P0C7W0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRR29P0C7W0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRR29P0C7W0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRR29P0C7W0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRR29P0C7W0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRR29P0C7W0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRR29P0C7W0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRR29P0C7W0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRR29P0C7W0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRR29P0C7W0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRR29P0C7W0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRR29P0C7W0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRR29P0C7W0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRR29P0C7W0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRR29P0C7W0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRR29P0C7W0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRR29P0C7W0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRR29P0C7W0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRR29P0C7W0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRR29P0C7W0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRR29P0C7W0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRR29P0C7W0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PRR29P0C7W0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PRR29P0C7W0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRR29P0C7W0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRR29P0C7W0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRR29P0C7W0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRR29P0C7W0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRR29P0C7W0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRR29P0C7W0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRR29P0C7W0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRR29P0C7W0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRR29P0C7W0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRR29P0C7W0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRR29P0C7W0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRR29P0C7W0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRR29P0C7W0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRR29P0C7W0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRR29P0C7W0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRR29P0C7W0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRR29P0C7W0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRR29P0C7W0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRR29P0C7W0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRR29P0C7W0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRR29P0C7W0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRR29P0C7W0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PRR29P0C7W0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRR29P0C7W0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRR29P0C7W0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRR29P0C7W0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRR29P0C7W0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRR29P0C7W0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRR29P0C7W0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRR29P0C7W0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRR29P0C7W0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRR29P0C7W0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRR29P0C7W0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRR29P0C7W0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRR29P0C7W0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRR29P0C7W0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRR29P0C7W0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRR29P0C7W0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PRR29P0C7W0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRR29P0C7W0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRR29P0C7W0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRR29P0C7W0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PRR29P0C7W0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRR29P0C7W0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRR29P0C7W0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRR29P0C7W0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRR29P0C7W0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRR29P0C7W0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRR29P0C7W0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRR29P0C7W0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRR29P0C7W0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRR29P0C7W0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRR29P0C7W0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRR29P0C7W0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.9 ms