Protein–RNA interactions for Protein: P04430

IGKV1-16, Immunoglobulin kappa variable 1-16, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-16P04430 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGKV1-16P04430 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGKV1-16P04430 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGKV1-16P04430 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV1-16P04430 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV1-16P04430 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV1-16P04430 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV1-16P04430 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1-16P04430 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1-16P04430 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1-16P04430 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGKV1-16P04430 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1-16P04430 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGKV1-16P04430 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGKV1-16P04430 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGKV1-16P04430 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms