Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAPBO95292 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAPBO95292 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAPBO95292 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAPBO95292 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAPBO95292 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAPBO95292 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAPBO95292 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAPBO95292 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAPBO95292 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAPBO95292 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAPBO95292 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VAPBO95292 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAPBO95292 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAPBO95292 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAPBO95292 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAPBO95292 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAPBO95292 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VAPBO95292 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VAPBO95292 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAPBO95292 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAPBO95292 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAPBO95292 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAPBO95292 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAPBO95292 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAPBO95292 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAPBO95292 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAPBO95292 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAPBO95292 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAPBO95292 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAPBO95292 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAPBO95292 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAPBO95292 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VAPBO95292 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAPBO95292 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAPBO95292 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAPBO95292 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAPBO95292 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAPBO95292 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VAPBO95292 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAPBO95292 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAPBO95292 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAPBO95292 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAPBO95292 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAPBO95292 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAPBO95292 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAPBO95292 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAPBO95292 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAPBO95292 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VAPBO95292 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VAPBO95292 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAPBO95292 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAPBO95292 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAPBO95292 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAPBO95292 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAPBO95292 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VAPBO95292 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VAPBO95292 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAPBO95292 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAPBO95292 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAPBO95292 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAPBO95292 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAPBO95292 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAPBO95292 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAPBO95292 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAPBO95292 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAPBO95292 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAPBO95292 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAPBO95292 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAPBO95292 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAPBO95292 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAPBO95292 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAPBO95292 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAPBO95292 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAPBO95292 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAPBO95292 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAPBO95292 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAPBO95292 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VAPBO95292 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAPBO95292 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAPBO95292 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAPBO95292 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAPBO95292 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAPBO95292 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAPBO95292 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAPBO95292 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAPBO95292 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAPBO95292 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAPBO95292 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAPBO95292 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAPBO95292 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAPBO95292 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAPBO95292 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAPBO95292 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAPBO95292 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAPBO95292 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAPBO95292 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAPBO95292 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAPBO95292 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAPBO95292 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms