Protein–RNA interactions for Protein: O00400

SLC33A1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC33A1O00400 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC33A1O00400 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC33A1O00400 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC33A1O00400 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC33A1O00400 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC33A1O00400 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC33A1O00400 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC33A1O00400 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC33A1O00400 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC33A1O00400 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC33A1O00400 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC33A1O00400 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC33A1O00400 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC33A1O00400 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC33A1O00400 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC33A1O00400 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC33A1O00400 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC33A1O00400 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC33A1O00400 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms