Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH8

HNRNPCL2, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL2B2RXH8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPCL2B2RXH8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPCL2B2RXH8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPCL2B2RXH8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HNRNPCL2B2RXH8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HNRNPCL2B2RXH8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HNRNPCL2B2RXH8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HNRNPCL2B2RXH8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HNRNPCL2B2RXH8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HNRNPCL2B2RXH8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HNRNPCL2B2RXH8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNRNPCL2B2RXH8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HNRNPCL2B2RXH8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HNRNPCL2B2RXH8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HNRNPCL2B2RXH8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HNRNPCL2B2RXH8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HNRNPCL2B2RXH8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms