Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRR3A8MPY1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRR3A8MPY1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR3A8MPY1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRR3A8MPY1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRR3A8MPY1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms