Protein–RNA interactions for Protein: A6NM45

CLDN24, Putative claudin-24, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN24A6NM45 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN24A6NM45 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN24A6NM45 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN24A6NM45 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLDN24A6NM45 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms