Protein–RNA interactions for Protein: A6NM45

CLDN24, Putative claudin-24, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN24A6NM45 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLDN24A6NM45 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CLDN24A6NM45 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CLDN24A6NM45 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CLDN24A6NM45 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLDN24A6NM45 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLDN24A6NM45 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLDN24A6NM45 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLDN24A6NM45 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLDN24A6NM45 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLDN24A6NM45 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLDN24A6NM45 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLDN24A6NM45 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLDN24A6NM45 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLDN24A6NM45 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLDN24A6NM45 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLDN24A6NM45 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLDN24A6NM45 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLDN24A6NM45 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CLDN24A6NM45 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLDN24A6NM45 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLDN24A6NM45 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLDN24A6NM45 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLDN24A6NM45 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLDN24A6NM45 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLDN24A6NM45 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLDN24A6NM45 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLDN24A6NM45 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLDN24A6NM45 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLDN24A6NM45 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLDN24A6NM45 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLDN24A6NM45 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLDN24A6NM45 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLDN24A6NM45 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLDN24A6NM45 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLDN24A6NM45 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLDN24A6NM45 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLDN24A6NM45 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLDN24A6NM45 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLDN24A6NM45 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLDN24A6NM45 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLDN24A6NM45 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLDN24A6NM45 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLDN24A6NM45 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLDN24A6NM45 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLDN24A6NM45 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLDN24A6NM45 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLDN24A6NM45 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLDN24A6NM45 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLDN24A6NM45 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CLDN24A6NM45 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLDN24A6NM45 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN24A6NM45 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLDN24A6NM45 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLDN24A6NM45 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLDN24A6NM45 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLDN24A6NM45 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLDN24A6NM45 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLDN24A6NM45 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN24A6NM45 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLDN24A6NM45 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN24A6NM45 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN24A6NM45 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLDN24A6NM45 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLDN24A6NM45 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN24A6NM45 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLDN24A6NM45 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLDN24A6NM45 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN24A6NM45 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN24A6NM45 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLDN24A6NM45 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN24A6NM45 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN24A6NM45 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN24A6NM45 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN24A6NM45 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN24A6NM45 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLDN24A6NM45 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLDN24A6NM45 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN24A6NM45 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN24A6NM45 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLDN24A6NM45 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLDN24A6NM45 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN24A6NM45 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN24A6NM45 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN24A6NM45 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN24A6NM45 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN24A6NM45 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN24A6NM45 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLDN24A6NM45 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN24A6NM45 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN24A6NM45 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN24A6NM45 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN24A6NM45 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN24A6NM45 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN24A6NM45 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN24A6NM45 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN24A6NM45 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN24A6NM45 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN24A6NM45 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN24A6NM45 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms