Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J263

TRAV39, T-cell receptor alpha variable 39 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV39A0A0B4J263 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV39A0A0B4J263 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV39A0A0B4J263 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV39A0A0B4J263 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV39A0A0B4J263 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV39A0A0B4J263 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV39A0A0B4J263 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV39A0A0B4J263 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV39A0A0B4J263 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAV39A0A0B4J263 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAV39A0A0B4J263 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV39A0A0B4J263 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV39A0A0B4J263 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAV39A0A0B4J263 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV39A0A0B4J263 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV39A0A0B4J263 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV39A0A0B4J263 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV39A0A0B4J263 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV39A0A0B4J263 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV39A0A0B4J263 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV39A0A0B4J263 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV39A0A0B4J263 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV39A0A0B4J263 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV39A0A0B4J263 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV39A0A0B4J263 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV39A0A0B4J263 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms