Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYO1AQ9UBC5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYO1AQ9UBC5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYO1AQ9UBC5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYO1AQ9UBC5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYO1AQ9UBC5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYO1AQ9UBC5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYO1AQ9UBC5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYO1AQ9UBC5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYO1AQ9UBC5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYO1AQ9UBC5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYO1AQ9UBC5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYO1AQ9UBC5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYO1AQ9UBC5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYO1AQ9UBC5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYO1AQ9UBC5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYO1AQ9UBC5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYO1AQ9UBC5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYO1AQ9UBC5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYO1AQ9UBC5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYO1AQ9UBC5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYO1AQ9UBC5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYO1AQ9UBC5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYO1AQ9UBC5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYO1AQ9UBC5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MYO1AQ9UBC5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MYO1AQ9UBC5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYO1AQ9UBC5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYO1AQ9UBC5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYO1AQ9UBC5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MYO1AQ9UBC5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYO1AQ9UBC5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYO1AQ9UBC5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYO1AQ9UBC5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MYO1AQ9UBC5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYO1AQ9UBC5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYO1AQ9UBC5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYO1AQ9UBC5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYO1AQ9UBC5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYO1AQ9UBC5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYO1AQ9UBC5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYO1AQ9UBC5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYO1AQ9UBC5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYO1AQ9UBC5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYO1AQ9UBC5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYO1AQ9UBC5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYO1AQ9UBC5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYO1AQ9UBC5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYO1AQ9UBC5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYO1AQ9UBC5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MYO1AQ9UBC5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYO1AQ9UBC5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYO1AQ9UBC5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYO1AQ9UBC5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYO1AQ9UBC5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYO1AQ9UBC5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYO1AQ9UBC5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYO1AQ9UBC5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYO1AQ9UBC5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYO1AQ9UBC5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYO1AQ9UBC5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYO1AQ9UBC5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MYO1AQ9UBC5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYO1AQ9UBC5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYO1AQ9UBC5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MYO1AQ9UBC5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYO1AQ9UBC5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYO1AQ9UBC5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYO1AQ9UBC5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1AQ9UBC5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1AQ9UBC5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1AQ9UBC5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYO1AQ9UBC5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYO1AQ9UBC5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYO1AQ9UBC5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYO1AQ9UBC5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYO1AQ9UBC5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYO1AQ9UBC5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYO1AQ9UBC5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1AQ9UBC5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO1AQ9UBC5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1AQ9UBC5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1AQ9UBC5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1AQ9UBC5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1AQ9UBC5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYO1AQ9UBC5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms