Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PITPNM3Q9BZ71 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PITPNM3Q9BZ71 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PITPNM3Q9BZ71 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PITPNM3Q9BZ71 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PITPNM3Q9BZ71 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITPNM3Q9BZ71 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PITPNM3Q9BZ71 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PITPNM3Q9BZ71 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PITPNM3Q9BZ71 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PITPNM3Q9BZ71 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PITPNM3Q9BZ71 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PITPNM3Q9BZ71 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PITPNM3Q9BZ71 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PITPNM3Q9BZ71 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PITPNM3Q9BZ71 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PITPNM3Q9BZ71 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PITPNM3Q9BZ71 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PITPNM3Q9BZ71 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PITPNM3Q9BZ71 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PITPNM3Q9BZ71 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PITPNM3Q9BZ71 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PITPNM3Q9BZ71 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PITPNM3Q9BZ71 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PITPNM3Q9BZ71 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PITPNM3Q9BZ71 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PITPNM3Q9BZ71 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PITPNM3Q9BZ71 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PITPNM3Q9BZ71 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PITPNM3Q9BZ71 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PITPNM3Q9BZ71 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PITPNM3Q9BZ71 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PITPNM3Q9BZ71 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PITPNM3Q9BZ71 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PITPNM3Q9BZ71 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PITPNM3Q9BZ71 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PITPNM3Q9BZ71 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PITPNM3Q9BZ71 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PITPNM3Q9BZ71 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PITPNM3Q9BZ71 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PITPNM3Q9BZ71 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PITPNM3Q9BZ71 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PITPNM3Q9BZ71 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PITPNM3Q9BZ71 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PITPNM3Q9BZ71 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PITPNM3Q9BZ71 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PITPNM3Q9BZ71 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PITPNM3Q9BZ71 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PITPNM3Q9BZ71 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PITPNM3Q9BZ71 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITPNM3Q9BZ71 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITPNM3Q9BZ71 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITPNM3Q9BZ71 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PITPNM3Q9BZ71 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PITPNM3Q9BZ71 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PITPNM3Q9BZ71 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PITPNM3Q9BZ71 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PITPNM3Q9BZ71 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITPNM3Q9BZ71 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITPNM3Q9BZ71 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PITPNM3Q9BZ71 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITPNM3Q9BZ71 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PITPNM3Q9BZ71 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PITPNM3Q9BZ71 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PITPNM3Q9BZ71 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PITPNM3Q9BZ71 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PITPNM3Q9BZ71 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PITPNM3Q9BZ71 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PITPNM3Q9BZ71 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PITPNM3Q9BZ71 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PITPNM3Q9BZ71 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PITPNM3Q9BZ71 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PITPNM3Q9BZ71 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PITPNM3Q9BZ71 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PITPNM3Q9BZ71 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PITPNM3Q9BZ71 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PITPNM3Q9BZ71 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PITPNM3Q9BZ71 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PITPNM3Q9BZ71 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PITPNM3Q9BZ71 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PITPNM3Q9BZ71 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PITPNM3Q9BZ71 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PITPNM3Q9BZ71 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITPNM3Q9BZ71 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PITPNM3Q9BZ71 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PITPNM3Q9BZ71 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms