Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KATNB1Q9BVA0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KATNB1Q9BVA0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KATNB1Q9BVA0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KATNB1Q9BVA0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KATNB1Q9BVA0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KATNB1Q9BVA0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KATNB1Q9BVA0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KATNB1Q9BVA0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KATNB1Q9BVA0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KATNB1Q9BVA0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KATNB1Q9BVA0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KATNB1Q9BVA0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KATNB1Q9BVA0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KATNB1Q9BVA0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KATNB1Q9BVA0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KATNB1Q9BVA0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KATNB1Q9BVA0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KATNB1Q9BVA0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KATNB1Q9BVA0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KATNB1Q9BVA0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KATNB1Q9BVA0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KATNB1Q9BVA0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KATNB1Q9BVA0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KATNB1Q9BVA0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KATNB1Q9BVA0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KATNB1Q9BVA0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KATNB1Q9BVA0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KATNB1Q9BVA0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KATNB1Q9BVA0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KATNB1Q9BVA0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNB1Q9BVA0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNB1Q9BVA0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNB1Q9BVA0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KATNB1Q9BVA0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KATNB1Q9BVA0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KATNB1Q9BVA0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KATNB1Q9BVA0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KATNB1Q9BVA0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KATNB1Q9BVA0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KATNB1Q9BVA0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNB1Q9BVA0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNB1Q9BVA0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNB1Q9BVA0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNB1Q9BVA0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KATNB1Q9BVA0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KATNB1Q9BVA0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KATNB1Q9BVA0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KATNB1Q9BVA0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KATNB1Q9BVA0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KATNB1Q9BVA0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KATNB1Q9BVA0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KATNB1Q9BVA0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KATNB1Q9BVA0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KATNB1Q9BVA0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KATNB1Q9BVA0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KATNB1Q9BVA0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KATNB1Q9BVA0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KATNB1Q9BVA0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KATNB1Q9BVA0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KATNB1Q9BVA0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KATNB1Q9BVA0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KATNB1Q9BVA0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KATNB1Q9BVA0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KATNB1Q9BVA0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KATNB1Q9BVA0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KATNB1Q9BVA0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KATNB1Q9BVA0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KATNB1Q9BVA0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KATNB1Q9BVA0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KATNB1Q9BVA0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KATNB1Q9BVA0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KATNB1Q9BVA0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KATNB1Q9BVA0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KATNB1Q9BVA0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KATNB1Q9BVA0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KATNB1Q9BVA0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KATNB1Q9BVA0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KATNB1Q9BVA0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KATNB1Q9BVA0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KATNB1Q9BVA0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KATNB1Q9BVA0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KATNB1Q9BVA0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KATNB1Q9BVA0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KATNB1Q9BVA0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KATNB1Q9BVA0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KATNB1Q9BVA0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KATNB1Q9BVA0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KATNB1Q9BVA0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KATNB1Q9BVA0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms