Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM46AQ96IP4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM46AQ96IP4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46AQ96IP4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46AQ96IP4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46AQ96IP4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM46AQ96IP4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46AQ96IP4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM46AQ96IP4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM46AQ96IP4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM46AQ96IP4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM46AQ96IP4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM46AQ96IP4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM46AQ96IP4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM46AQ96IP4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM46AQ96IP4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM46AQ96IP4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM46AQ96IP4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM46AQ96IP4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM46AQ96IP4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM46AQ96IP4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM46AQ96IP4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM46AQ96IP4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM46AQ96IP4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM46AQ96IP4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM46AQ96IP4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM46AQ96IP4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM46AQ96IP4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM46AQ96IP4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM46AQ96IP4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM46AQ96IP4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM46AQ96IP4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM46AQ96IP4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM46AQ96IP4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM46AQ96IP4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM46AQ96IP4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM46AQ96IP4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM46AQ96IP4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM46AQ96IP4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM46AQ96IP4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM46AQ96IP4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM46AQ96IP4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM46AQ96IP4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM46AQ96IP4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM46AQ96IP4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM46AQ96IP4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM46AQ96IP4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM46AQ96IP4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM46AQ96IP4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM46AQ96IP4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46AQ96IP4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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