Protein–RNA interactions for Protein: Q969M1

TOMM40L, Mitochondrial import receptor subunit TOM40B, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40LQ969M1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TOMM40LQ969M1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOMM40LQ969M1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOMM40LQ969M1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOMM40LQ969M1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOMM40LQ969M1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOMM40LQ969M1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOMM40LQ969M1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOMM40LQ969M1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOMM40LQ969M1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOMM40LQ969M1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOMM40LQ969M1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOMM40LQ969M1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOMM40LQ969M1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOMM40LQ969M1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOMM40LQ969M1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOMM40LQ969M1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOMM40LQ969M1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOMM40LQ969M1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOMM40LQ969M1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOMM40LQ969M1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOMM40LQ969M1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOMM40LQ969M1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOMM40LQ969M1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOMM40LQ969M1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOMM40LQ969M1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOMM40LQ969M1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOMM40LQ969M1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOMM40LQ969M1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOMM40LQ969M1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOMM40LQ969M1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOMM40LQ969M1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOMM40LQ969M1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOMM40LQ969M1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOMM40LQ969M1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOMM40LQ969M1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOMM40LQ969M1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOMM40LQ969M1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TOMM40LQ969M1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOMM40LQ969M1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOMM40LQ969M1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOMM40LQ969M1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOMM40LQ969M1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOMM40LQ969M1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms