Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE7

TMEM170A, Transmembrane protein 170A, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM170AQ8WVE7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM170AQ8WVE7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM170AQ8WVE7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM170AQ8WVE7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM170AQ8WVE7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM170AQ8WVE7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM170AQ8WVE7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM170AQ8WVE7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM170AQ8WVE7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM170AQ8WVE7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM170AQ8WVE7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM170AQ8WVE7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM170AQ8WVE7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM170AQ8WVE7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM170AQ8WVE7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM170AQ8WVE7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM170AQ8WVE7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM170AQ8WVE7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM170AQ8WVE7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM170AQ8WVE7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM170AQ8WVE7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM170AQ8WVE7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM170AQ8WVE7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM170AQ8WVE7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM170AQ8WVE7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM170AQ8WVE7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM170AQ8WVE7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM170AQ8WVE7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM170AQ8WVE7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM170AQ8WVE7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM170AQ8WVE7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM170AQ8WVE7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM170AQ8WVE7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM170AQ8WVE7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM170AQ8WVE7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM170AQ8WVE7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms