Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ6

PROKR2, Prokineticin receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROKR2Q8NFJ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROKR2Q8NFJ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROKR2Q8NFJ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROKR2Q8NFJ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROKR2Q8NFJ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROKR2Q8NFJ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROKR2Q8NFJ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PROKR2Q8NFJ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROKR2Q8NFJ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROKR2Q8NFJ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROKR2Q8NFJ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROKR2Q8NFJ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROKR2Q8NFJ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROKR2Q8NFJ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROKR2Q8NFJ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROKR2Q8NFJ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROKR2Q8NFJ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROKR2Q8NFJ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROKR2Q8NFJ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROKR2Q8NFJ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROKR2Q8NFJ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROKR2Q8NFJ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROKR2Q8NFJ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROKR2Q8NFJ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROKR2Q8NFJ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROKR2Q8NFJ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PROKR2Q8NFJ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROKR2Q8NFJ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROKR2Q8NFJ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROKR2Q8NFJ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROKR2Q8NFJ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PROKR2Q8NFJ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROKR2Q8NFJ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROKR2Q8NFJ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROKR2Q8NFJ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROKR2Q8NFJ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROKR2Q8NFJ6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PROKR2Q8NFJ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROKR2Q8NFJ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROKR2Q8NFJ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROKR2Q8NFJ6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PROKR2Q8NFJ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROKR2Q8NFJ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PROKR2Q8NFJ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROKR2Q8NFJ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROKR2Q8NFJ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROKR2Q8NFJ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROKR2Q8NFJ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROKR2Q8NFJ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROKR2Q8NFJ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROKR2Q8NFJ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROKR2Q8NFJ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROKR2Q8NFJ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROKR2Q8NFJ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PROKR2Q8NFJ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PROKR2Q8NFJ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PROKR2Q8NFJ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROKR2Q8NFJ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROKR2Q8NFJ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PROKR2Q8NFJ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROKR2Q8NFJ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROKR2Q8NFJ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROKR2Q8NFJ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROKR2Q8NFJ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROKR2Q8NFJ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROKR2Q8NFJ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROKR2Q8NFJ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROKR2Q8NFJ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROKR2Q8NFJ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROKR2Q8NFJ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms