Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXM7

ODF3L1, Outer dense fiber protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L1Q8IXM7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF3L1Q8IXM7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF3L1Q8IXM7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF3L1Q8IXM7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF3L1Q8IXM7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF3L1Q8IXM7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF3L1Q8IXM7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF3L1Q8IXM7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF3L1Q8IXM7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF3L1Q8IXM7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF3L1Q8IXM7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF3L1Q8IXM7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF3L1Q8IXM7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF3L1Q8IXM7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF3L1Q8IXM7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF3L1Q8IXM7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF3L1Q8IXM7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF3L1Q8IXM7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF3L1Q8IXM7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF3L1Q8IXM7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF3L1Q8IXM7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF3L1Q8IXM7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF3L1Q8IXM7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF3L1Q8IXM7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF3L1Q8IXM7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF3L1Q8IXM7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ODF3L1Q8IXM7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ODF3L1Q8IXM7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF3L1Q8IXM7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ODF3L1Q8IXM7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF3L1Q8IXM7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF3L1Q8IXM7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF3L1Q8IXM7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF3L1Q8IXM7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF3L1Q8IXM7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF3L1Q8IXM7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF3L1Q8IXM7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF3L1Q8IXM7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF3L1Q8IXM7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF3L1Q8IXM7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF3L1Q8IXM7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF3L1Q8IXM7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF3L1Q8IXM7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF3L1Q8IXM7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF3L1Q8IXM7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF3L1Q8IXM7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ODF3L1Q8IXM7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODF3L1Q8IXM7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODF3L1Q8IXM7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ODF3L1Q8IXM7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF3L1Q8IXM7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF3L1Q8IXM7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF3L1Q8IXM7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF3L1Q8IXM7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF3L1Q8IXM7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms