Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWN0

LYPD4, Ly6/PLAUR domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD4Q6UWN0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYPD4Q6UWN0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYPD4Q6UWN0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYPD4Q6UWN0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYPD4Q6UWN0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYPD4Q6UWN0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYPD4Q6UWN0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYPD4Q6UWN0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYPD4Q6UWN0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYPD4Q6UWN0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LYPD4Q6UWN0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYPD4Q6UWN0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYPD4Q6UWN0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYPD4Q6UWN0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYPD4Q6UWN0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYPD4Q6UWN0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYPD4Q6UWN0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYPD4Q6UWN0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYPD4Q6UWN0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYPD4Q6UWN0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYPD4Q6UWN0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYPD4Q6UWN0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYPD4Q6UWN0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYPD4Q6UWN0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYPD4Q6UWN0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYPD4Q6UWN0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYPD4Q6UWN0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYPD4Q6UWN0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYPD4Q6UWN0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYPD4Q6UWN0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYPD4Q6UWN0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYPD4Q6UWN0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYPD4Q6UWN0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYPD4Q6UWN0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYPD4Q6UWN0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYPD4Q6UWN0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYPD4Q6UWN0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYPD4Q6UWN0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYPD4Q6UWN0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LYPD4Q6UWN0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYPD4Q6UWN0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYPD4Q6UWN0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LYPD4Q6UWN0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYPD4Q6UWN0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYPD4Q6UWN0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LYPD4Q6UWN0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LYPD4Q6UWN0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms