Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00242Q5T6M2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00242Q5T6M2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00242Q5T6M2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00242Q5T6M2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00242Q5T6M2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00242Q5T6M2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00242Q5T6M2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00242Q5T6M2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00242Q5T6M2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00242Q5T6M2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00242Q5T6M2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00242Q5T6M2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00242Q5T6M2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00242Q5T6M2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00242Q5T6M2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00242Q5T6M2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00242Q5T6M2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00242Q5T6M2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00242Q5T6M2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00242Q5T6M2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00242Q5T6M2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00242Q5T6M2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00242Q5T6M2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00242Q5T6M2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00242Q5T6M2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00242Q5T6M2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00242Q5T6M2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00242Q5T6M2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00242Q5T6M2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00242Q5T6M2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00242Q5T6M2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms