Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SS18Q15532 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SS18Q15532 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SS18Q15532 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SS18Q15532 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SS18Q15532 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SS18Q15532 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SS18Q15532 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SS18Q15532 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SS18Q15532 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SS18Q15532 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SS18Q15532 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SS18Q15532 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18Q15532 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18Q15532 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18Q15532 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18Q15532 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18Q15532 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18Q15532 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18Q15532 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SS18Q15532 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SS18Q15532 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SS18Q15532 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SS18Q15532 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SS18Q15532 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SS18Q15532 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SS18Q15532 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SS18Q15532 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SS18Q15532 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SS18Q15532 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SS18Q15532 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SS18Q15532 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SS18Q15532 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SS18Q15532 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SS18Q15532 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SS18Q15532 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SS18Q15532 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SS18Q15532 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SS18Q15532 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SS18Q15532 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SS18Q15532 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SS18Q15532 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SS18Q15532 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SS18Q15532 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SS18Q15532 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SS18Q15532 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SS18Q15532 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SS18Q15532 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SS18Q15532 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SS18Q15532 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SS18Q15532 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SS18Q15532 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SS18Q15532 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SS18Q15532 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SS18Q15532 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SS18Q15532 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SS18Q15532 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SS18Q15532 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SS18Q15532 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SS18Q15532 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18Q15532 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18Q15532 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18Q15532 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18Q15532 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18Q15532 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18Q15532 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18Q15532 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18Q15532 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18Q15532 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18Q15532 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SS18Q15532 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SS18Q15532 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SS18Q15532 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SS18Q15532 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SS18Q15532 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SS18Q15532 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18Q15532 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18Q15532 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18Q15532 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18Q15532 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18Q15532 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18Q15532 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18Q15532 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SS18Q15532 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SS18Q15532 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SS18Q15532 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SS18Q15532 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SS18Q15532 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SS18Q15532 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SS18Q15532 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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