Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SS18Q15532 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SS18Q15532 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SS18Q15532 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SS18Q15532 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SS18Q15532 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SS18Q15532 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SS18Q15532 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SS18Q15532 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SS18Q15532 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SS18Q15532 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SS18Q15532 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SS18Q15532 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SS18Q15532 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SS18Q15532 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SS18Q15532 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SS18Q15532 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SS18Q15532 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SS18Q15532 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SS18Q15532 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SS18Q15532 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SS18Q15532 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SS18Q15532 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SS18Q15532 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SS18Q15532 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SS18Q15532 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SS18Q15532 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SS18Q15532 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SS18Q15532 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SS18Q15532 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SS18Q15532 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SS18Q15532 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SS18Q15532 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SS18Q15532 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SS18Q15532 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SS18Q15532 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SS18Q15532 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SS18Q15532 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SS18Q15532 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SS18Q15532 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SS18Q15532 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SS18Q15532 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SS18Q15532 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SS18Q15532 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SS18Q15532 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SS18Q15532 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SS18Q15532 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SS18Q15532 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SS18Q15532 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SS18Q15532 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SS18Q15532 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SS18Q15532 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SS18Q15532 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SS18Q15532 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SS18Q15532 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SS18Q15532 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SS18Q15532 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SS18Q15532 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SS18Q15532 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SS18Q15532 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SS18Q15532 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SS18Q15532 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SS18Q15532 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SS18Q15532 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SS18Q15532 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SS18Q15532 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SS18Q15532 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SS18Q15532 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18Q15532 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SS18Q15532 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SS18Q15532 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SS18Q15532 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SS18Q15532 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SS18Q15532 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SS18Q15532 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SS18Q15532 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SS18Q15532 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SS18Q15532 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SS18Q15532 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SS18Q15532 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SS18Q15532 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SS18Q15532 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SS18Q15532 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SS18Q15532 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SS18Q15532 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SS18Q15532 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SS18Q15532 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SS18Q15532 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SS18Q15532 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SS18Q15532 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SS18Q15532 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SS18Q15532 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SS18Q15532 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SS18Q15532 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SS18Q15532 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SS18Q15532 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SS18Q15532 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SS18Q15532 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SS18Q15532 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SS18Q15532 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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