Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COX10Q12887 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COX10Q12887 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COX10Q12887 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COX10Q12887 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
COX10Q12887 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX10Q12887 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX10Q12887 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX10Q12887 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX10Q12887 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX10Q12887 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX10Q12887 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX10Q12887 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX10Q12887 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX10Q12887 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX10Q12887 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX10Q12887 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX10Q12887 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX10Q12887 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX10Q12887 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX10Q12887 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX10Q12887 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX10Q12887 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX10Q12887 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX10Q12887 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX10Q12887 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX10Q12887 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX10Q12887 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COX10Q12887 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COX10Q12887 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX10Q12887 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX10Q12887 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COX10Q12887 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COX10Q12887 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COX10Q12887 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COX10Q12887 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COX10Q12887 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX10Q12887 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX10Q12887 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COX10Q12887 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COX10Q12887 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COX10Q12887 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX10Q12887 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX10Q12887 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COX10Q12887 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COX10Q12887 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX10Q12887 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX10Q12887 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX10Q12887 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX10Q12887 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX10Q12887 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX10Q12887 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COX10Q12887 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX10Q12887 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COX10Q12887 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX10Q12887 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX10Q12887 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX10Q12887 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COX10Q12887 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COX10Q12887 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COX10Q12887 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COX10Q12887 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COX10Q12887 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COX10Q12887 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COX10Q12887 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COX10Q12887 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COX10Q12887 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COX10Q12887 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COX10Q12887 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COX10Q12887 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COX10Q12887 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COX10Q12887 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COX10Q12887 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COX10Q12887 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COX10Q12887 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COX10Q12887 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COX10Q12887 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COX10Q12887 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COX10Q12887 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COX10Q12887 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COX10Q12887 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COX10Q12887 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COX10Q12887 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COX10Q12887 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COX10Q12887 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COX10Q12887 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COX10Q12887 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COX10Q12887 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COX10Q12887 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COX10Q12887 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COX10Q12887 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COX10Q12887 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COX10Q12887 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COX10Q12887 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COX10Q12887 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COX10Q12887 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COX10Q12887 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COX10Q12887 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COX10Q12887 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COX10Q12887 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms