Protein–RNA interactions for Protein: P54803

GALC, Galactocerebrosidase, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALCP54803 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GALCP54803 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GALCP54803 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GALCP54803 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GALCP54803 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GALCP54803 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GALCP54803 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GALCP54803 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GALCP54803 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GALCP54803 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GALCP54803 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GALCP54803 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GALCP54803 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GALCP54803 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GALCP54803 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GALCP54803 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GALCP54803 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GALCP54803 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GALCP54803 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GALCP54803 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GALCP54803 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GALCP54803 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GALCP54803 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GALCP54803 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GALCP54803 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GALCP54803 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GALCP54803 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GALCP54803 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GALCP54803 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GALCP54803 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GALCP54803 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GALCP54803 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GALCP54803 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GALCP54803 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GALCP54803 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GALCP54803 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GALCP54803 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GALCP54803 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GALCP54803 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GALCP54803 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GALCP54803 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GALCP54803 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GALCP54803 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GALCP54803 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GALCP54803 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GALCP54803 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GALCP54803 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GALCP54803 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GALCP54803 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GALCP54803 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GALCP54803 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GALCP54803 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GALCP54803 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GALCP54803 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GALCP54803 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GALCP54803 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GALCP54803 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GALCP54803 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GALCP54803 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GALCP54803 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GALCP54803 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GALCP54803 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GALCP54803 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GALCP54803 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GALCP54803 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GALCP54803 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GALCP54803 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GALCP54803 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GALCP54803 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GALCP54803 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GALCP54803 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GALCP54803 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GALCP54803 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GALCP54803 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GALCP54803 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GALCP54803 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GALCP54803 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GALCP54803 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GALCP54803 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GALCP54803 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GALCP54803 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GALCP54803 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GALCP54803 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GALCP54803 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GALCP54803 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GALCP54803 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GALCP54803 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GALCP54803 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GALCP54803 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GALCP54803 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GALCP54803 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GALCP54803 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GALCP54803 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GALCP54803 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GALCP54803 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GALCP54803 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GALCP54803 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GALCP54803 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GALCP54803 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GALCP54803 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms