Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PEX5P50542 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PEX5P50542 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PEX5P50542 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PEX5P50542 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PEX5P50542 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PEX5P50542 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PEX5P50542 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PEX5P50542 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PEX5P50542 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PEX5P50542 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PEX5P50542 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PEX5P50542 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PEX5P50542 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PEX5P50542 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PEX5P50542 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PEX5P50542 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PEX5P50542 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PEX5P50542 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PEX5P50542 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PEX5P50542 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PEX5P50542 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PEX5P50542 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PEX5P50542 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PEX5P50542 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PEX5P50542 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PEX5P50542 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PEX5P50542 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PEX5P50542 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PEX5P50542 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PEX5P50542 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PEX5P50542 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PEX5P50542 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PEX5P50542 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PEX5P50542 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PEX5P50542 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PEX5P50542 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PEX5P50542 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PEX5P50542 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PEX5P50542 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PEX5P50542 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PEX5P50542 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PEX5P50542 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PEX5P50542 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PEX5P50542 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PEX5P50542 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PEX5P50542 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PEX5P50542 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PEX5P50542 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PEX5P50542 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PEX5P50542 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PEX5P50542 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PEX5P50542 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PEX5P50542 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PEX5P50542 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PEX5P50542 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PEX5P50542 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PEX5P50542 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PEX5P50542 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PEX5P50542 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PEX5P50542 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PEX5P50542 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PEX5P50542 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PEX5P50542 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PEX5P50542 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PEX5P50542 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PEX5P50542 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PEX5P50542 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PEX5P50542 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PEX5P50542 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PEX5P50542 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PEX5P50542 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PEX5P50542 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PEX5P50542 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PEX5P50542 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PEX5P50542 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PEX5P50542 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PEX5P50542 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PEX5P50542 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PEX5P50542 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PEX5P50542 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PEX5P50542 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PEX5P50542 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PEX5P50542 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PEX5P50542 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PEX5P50542 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PEX5P50542 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PEX5P50542 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PEX5P50542 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PEX5P50542 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PEX5P50542 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PEX5P50542 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PEX5P50542 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PEX5P50542 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PEX5P50542 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PEX5P50542 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PEX5P50542 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PEX5P50542 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PEX5P50542 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PEX5P50542 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms