Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A6P48664 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A6P48664 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC1A6P48664 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A6P48664 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC1A6P48664 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC1A6P48664 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A6P48664 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A6P48664 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A6P48664 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A6P48664 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A6P48664 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A6P48664 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A6P48664 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A6P48664 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A6P48664 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC1A6P48664 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC1A6P48664 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A6P48664 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A6P48664 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A6P48664 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A6P48664 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A6P48664 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A6P48664 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A6P48664 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A6P48664 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A6P48664 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A6P48664 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A6P48664 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A6P48664 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A6P48664 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A6P48664 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A6P48664 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A6P48664 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A6P48664 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC1A6P48664 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC1A6P48664 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A6P48664 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A6P48664 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A6P48664 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A6P48664 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A6P48664 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A6P48664 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC1A6P48664 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A6P48664 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A6P48664 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A6P48664 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A6P48664 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A6P48664 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A6P48664 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC1A6P48664 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC1A6P48664 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A6P48664 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A6P48664 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A6P48664 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A6P48664 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A6P48664 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A6P48664 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A6P48664 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A6P48664 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A6P48664 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC1A6P48664 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC1A6P48664 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC1A6P48664 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A6P48664 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A6P48664 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A6P48664 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A6P48664 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC1A6P48664 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC1A6P48664 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC1A6P48664 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A6P48664 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A6P48664 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A6P48664 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A6P48664 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A6P48664 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A6P48664 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A6P48664 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A6P48664 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A6P48664 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A6P48664 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A6P48664 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A6P48664 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC1A6P48664 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC1A6P48664 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC1A6P48664 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms