Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6V1E1P36543 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6V1E1P36543 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6V1E1P36543 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6V1E1P36543 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6V1E1P36543 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1E1P36543 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1E1P36543 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1E1P36543 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6V1E1P36543 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6V1E1P36543 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1E1P36543 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1E1P36543 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6V1E1P36543 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6V1E1P36543 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1E1P36543 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1E1P36543 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1E1P36543 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1E1P36543 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1E1P36543 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP6V1E1P36543 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP6V1E1P36543 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1E1P36543 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1E1P36543 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1E1P36543 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1E1P36543 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1E1P36543 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1E1P36543 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1E1P36543 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1E1P36543 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1E1P36543 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1E1P36543 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1E1P36543 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1E1P36543 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1E1P36543 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1E1P36543 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1E1P36543 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1E1P36543 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1E1P36543 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1E1P36543 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1E1P36543 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1E1P36543 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1E1P36543 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1E1P36543 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1E1P36543 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1E1P36543 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1E1P36543 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1E1P36543 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1E1P36543 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6V1E1P36543 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1E1P36543 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1E1P36543 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1E1P36543 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1E1P36543 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1E1P36543 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1E1P36543 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1E1P36543 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1E1P36543 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP6V1E1P36543 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1E1P36543 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V1E1P36543 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V1E1P36543 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1E1P36543 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1E1P36543 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1E1P36543 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1E1P36543 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1E1P36543 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1E1P36543 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1E1P36543 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms