Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNCP24821 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNCP24821 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNCP24821 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNCP24821 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNCP24821 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNCP24821 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNCP24821 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNCP24821 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNCP24821 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNCP24821 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNCP24821 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNCP24821 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNCP24821 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNCP24821 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNCP24821 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNCP24821 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNCP24821 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNCP24821 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNCP24821 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNCP24821 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNCP24821 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNCP24821 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNCP24821 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNCP24821 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNCP24821 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNCP24821 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNCP24821 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNCP24821 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNCP24821 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNCP24821 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNCP24821 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNCP24821 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNCP24821 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNCP24821 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNCP24821 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNCP24821 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNCP24821 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNCP24821 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNCP24821 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNCP24821 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNCP24821 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNCP24821 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNCP24821 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNCP24821 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNCP24821 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNCP24821 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNCP24821 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNCP24821 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNCP24821 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNCP24821 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNCP24821 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNCP24821 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNCP24821 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNCP24821 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNCP24821 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNCP24821 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNCP24821 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNCP24821 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TNCP24821 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNCP24821 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNCP24821 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNCP24821 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNCP24821 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNCP24821 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNCP24821 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNCP24821 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNCP24821 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNCP24821 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNCP24821 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNCP24821 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNCP24821 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNCP24821 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNCP24821 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNCP24821 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNCP24821 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNCP24821 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNCP24821 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNCP24821 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNCP24821 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNCP24821 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNCP24821 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNCP24821 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNCP24821 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNCP24821 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNCP24821 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNCP24821 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNCP24821 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNCP24821 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNCP24821 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNCP24821 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNCP24821 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNCP24821 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNCP24821 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNCP24821 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNCP24821 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNCP24821 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNCP24821 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNCP24821 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNCP24821 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms